Sürekli olarak Ben 10'a zarar vermek için çaba gösteren Dr. animo, yine kötülükler peşinde koşuyor. Onun hayvanları mutant haline getirerek Ben 10'a karşı kullandığını biliyoruz. Bu oyundada farklı şeyler düşünmüyor. Ben 10'un çok uzakta olduğu zamanlarda özel arabaya göz dikiyor. Arabanın içerisinde bulunan Ben 10'a ait bir parçayı almak için mutanta dönüştürdüğü bir hayvanı gönderiyor. Bunu başarılı bir şekilde tamamlıyor. Ben 10 bu konu ile ilgili detayları öğrendiğinde ise hızla Dr. animonun peşine düşüyor. Fazla vakti kalmadı, geç kalırsa hiç iyi şeyler olmayacaktır.
Ben 10 bölgeye gitmek için kısa sürede hazırlanıyor. Hazırlıkları bittiğinde 4 karakteri ile birlikte yola koyuluyor. Oyun içerisinde dilediğiniz yerde karakterinizi değiştirebilirsiniz. Bu işlemi yaparken oyunun üst kısmında yer alan yeşil bara dikkat ediniz. İlgili yer boşaldığında tekrar Ben 10'a dönüşürsünüz. Her karakterin birbirinden farklı özelliği var. Düşmanların karşısına çıkmadan karakterleri test ederseniz onların karşısına hazırlıklı olarak çıkmış olursunuz.